1993 年以来、理学部数学科は解析数理、構造数理及び応用数理という三つの講座から構成されている。しかしこの講座への分類はゆるやかなもので、理念の中にもあるように、講座を超えた教育研究体制を模索している。各講座の大まかな分野構成については次の通りである。

現象の変化や無限に潜む数学的構造の解明を目指す解析学において、 関数方程式、関数解析、複素解析、調和解析、代数解析、微分方程式等の分野の教育研究を行う。

式や空間の持つ対称性や連続性などの構造に着目し、その背景にある数学的本質の解明を目指す代数学及び幾何学において、整数論、保型形式、代数幾何、微分幾何、位相幾何等の分野の教育研究を行う。

理学、工学、計算機科学、経済学分野と関わる応用数学において、確率論、組み合わせ論、保型形式論、整数論、計算数学、情報科学、数理物理及びそれらの応用について教育研究を行う。